磺化修饰结合离子交换色谱和生物质谱富集鉴定含组氨酸肽段

色谱 , 2009, 27(2): 158-163. doi: 10.3321/j.issn:1000-8713.2009.02.006

磺化修饰结合离子交换色谱和生物质谱富集鉴定含组氨酸肽段

曹冬 ^1, , 周春喜 ^2, , 张养军 ^3, , 韩春光 ^4, , 邓玉林 ^5, , 钱小红 ^6,

1.北京理工大学,北京,100081;北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,北京放射与辐射医学研究所,北京,102206

2.北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,北京放射与辐射医学研究所,北京,102206

3.北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,北京放射与辐射医学研究所,北京,102206

4.北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,北京放射与辐射医学研究所,北京,102206

5.北京理工大学,北京,100081

6.北京蛋白质组研究中心,蛋白质组学国家重点实验室,北京放射与辐射医学研究所,北京,102206

基金项目: 国家重点基础研究发展规划(973计划)(2007CB914104;2006AA02A308) 国家自然科学基金(20505018;20635010;20735005;20875101)

关键词：强阳离子交换色谱 , 基质辅助激光解吸电离飞行时间串联质谱 , 磺化修饰 , 富集 , 鉴定 , 组氨酸标签肽

Sulfonation modification-assisted enrichment and identification of histidine-containing peptides by strong cation exchange chromatography and mass spectrometry

通过在肽段的N端引入磺酸基,从而使含组氨酸的肽段与其他肽段在pH<3.0的条件下产生电荷差异,建立了一种基于强阳离子交换色谱(SCX)结合生物质谱富集鉴定含组氨酸肽段的方法,并以含有组氨酸的标准蛋白质为模型,进行了方法学考察.结果表明,经N端磺酸化后,含组氨酸的肽段能有效地被阳离子交换色谱富集,且在肽的N端引入磺酸基促进了肽的裂解,使之产生简单而信息丰富的二级质谱图,从而得到完美的质谱鉴定结果.这说明磺化修饰结合强阳离子交换色谱用于含组氨酸肽段的富集鉴定是可行的,且具有在蛋白质组研究中应用的潜力.

参考文献

[1]	Takahashi N,Takahashi Y,Putanm F W.J Chromatogr A,1983,266:511
[2]	Washburn M P,Wolters D,Yates J R.Nat Biotech,2001,19(3):242
[3]	Julka S,Regnier F E.J Proteome Res,2004,3(3):350
[4]	Nakazawa T,Yamaguchi M,Okamura T A,et al.Proteomics,2008,8(4):673
[5]	Meinnel T,Giglione C.Proteomics,2008,8(4):626
[6]	Mikami T,Takao T.Anal Chem,2007,79(20):7910
[7]	Shen P T,Hsu J L,Chen S H.Anal Chem,2007,79(24):9520
[8]	Geng M,Ji J,Regnier F E.J Chromatogr A,2000,870:295
[9]	Wang S,Regnier F E.J Chromatogr A,2001,924:345[10] Gygi S P,Rist B,Gerber S A,et al.Nat Biotechnol,1999,17(10):994
[10]	Wang S,Regnier F E.J Chromatogr A,2001,924:345[10] Gygi S P,Rist B,Gerber S A,et al.Nat Biotechnol,1999,17(10):994
[11]	Ji J,Chakraborty A,Geng M,et al.J Chromatogr B,2000,745(1):197
[12]	Hansen P,Lindeberg G.J Chromatogr A,1995,690(2):155
[13]	Chaga G S.J Biochem Biophys Methods,2001,49:313
[14]	Amini A,Chakraborty A,Regnier F E.J Chromatogr B,2002,772(1):35
[15]	Ren D,Penner N A,Slentz B E,et al.J Proteome Res,2003,2(3):321
[16]	Keough T,Youngquist R S,Lacey M P.Proc Natl Acad Sci USA,1999,96(13):7131
[17]	Keough T,Lacey M P,Youngquist R S.Rapid Commun Mass Spectrom,2000,14(24):2348
[18]	Betancourt L,Gil J,Besada V,et al.J Proteome Res,2005,4(2):491
[19]	Dai J Q,Zhang Y J,Wang J L,et al.Rapid Commun Mass Spectrom,2005,19(9):1130
[20]	Beausoleil S A,Jedrychowski M,Schwartz D,et al.Proc Natl Acad Sci USA,2004,101(33):12130
[21]	Zhang H,Yan W,Aebersold R.Curr Opin Chem Biol,2004,8:66
[22]	Alpert A J,Andrews P C.J Chromatogr,1988,443:85
[23]	Lee Y H,Han H,Chang S B,et al.Rapid Commun Mass Spectrom,2004,18(24):3019
[24]	Chen P,Nie S,Mi W,et al.Rapid Commun Mass Spectrom,2004,18(2):191
[25]	Rabenstein D L,Hari S P,Kaerner A.Anal Chem,1997,69(21):4310
[26]	Dongre A R,Somogyi A,Wysocki V H.J Mass Spectrom,1996,31(4):339
[27]	Paizs B,Suhai S.Mass Spectrom Rev,2005,24(4):508

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