蛋白质的N-糖基化是最重要的翻译后修饰之一,许多已知的血浆肿瘤诊断标志物及治疗靶标都是N-糖基化蛋白.针对血浆的糖蛋白质组研究有利于发现新的蛋白标志物.然而,血浆蛋白质浓度分布的动态范围非常宽,且同一位点上的糖链存在微观不均一性,影响了血浆中糖蛋白的鉴定效率.本文利用亲水材料ZIC-HILIC制备亲水富集柱分别对人血浆中的N-糖链和N-糖肽进行富集,并结合碱性反相色谱进行肽段的预分离和高准确度质谱分析,最终在健康人的血浆中鉴定到了299个糖基化蛋白、637个糖基化位点,并识别出31种不同的糖型.在这些鉴定到的糖基化位点中,新发现有107个N-糖基化位点(占总位点数的16.8％).本方法操作简单,可以有效富集N-糖肽和N-糖,为在血浆中寻找糖蛋白和糖链生物标志物提供了可靠的手段.
参考文献
| [1] | Liu T,Qian W J,Gritsenko M A,et al.J Proteome Res,2005,4 (6):2070 |
| [2] | Wright L M,Kreikemeier J T,Fimmel C J,et al.Cancer Detect Prev,2007,31 (1):35 |
| [3] | Leighton P C,Kitau M J,Chard T,et al.Lancet,1975,2(7943):1012 |
| [4] | Geng F,Shi B Z,Yuan Y F,et al.Cell Res,2004,14(5):423 |
| [5] | Anderson N L,Anderson N G.MCP,2002,1 (11):845 |
| [6] | Pieper R,Gatlin C L,Makusky A J,et al.Proteomics,2003,3(7):1345 |
| [7] | Sun B,Ranish J A,Utleg A G,et al.Mol Cell Proteomics,2007,6(1):141 |
| [8] | Yang Z,Hancock W S.J Chromatogr A,2004,1053(1/2):79 |
| [9] | Boersema P J,Mohammed S,Heck A J R,et al.Anal Bioanal Chem,2008,391(1):151 |
| [10] | Tian Y,Zhou Y,Elliot S,et al.Nat Protoc,2007,2 (2):334 |
| [11] | Kaji H,Shikanai T,Sasaki-Sawa A,et al.J Proteome Res,2012,11(6):4553 |
| [12] | Zielinska D F,Gnad F,WisniewskiJ R,etal.Cell,2010,141(5):897 |
| [13] | Liang X M.Chinese Journal of Chromatography (梁鑫淼.色谱),2011,29 (3):191 |
| [14] | Calvano C D,Zambonin C G,Jensen O N,et al.J Proteomics,2008,71(3):304 |
| [15] | Wisniewski J R,Zougman A,Nagaraj N,et al.Nat Methods,2009,6 (5):359 |
| [16] | Peng J,Elias J E,Thoreen C C,et al.J Proteome Res,2003,2(1):43 |
| [17] | Schwartz D,Gygi S P.Nat Biotechnol,2005,23(11):1391 |
| [18] | Colaert N,Helsens K,Martens L,et al.Nat Methods,2009,6(11):786 |
| [19] | Delmotte N,Lasaosa M,Tholey A,et al.J Proteome Res,2007,6(11):4363 |
| [20] | Farrah T,Deutsch E W,Omenn G S,et al.Mol Cell Proteomics,2011,10(9):M110.006353 |
上一张
下一张
上一张
下一张
计量
- 下载量()
- 访问量()
文章评分
- 您的评分：
-
10%
-
20%
-
30%
-
40%
-
50%