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全细胞的核酸适配体筛选的研究进展

刘品多 , 屈锋

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2015.12015

核酸适配体(aptamer)是从人工合成的随机单链 DNA(ssDNA)或 RNA 文库中筛选得到的,能够高亲和力、高特异性地与靶标结合的 ssDNA或 RNA。核酸适配体的靶标范围广,可包括小分子、蛋白质、细胞、微生物等多种靶标。其中以细胞为靶标的适配体在生物感应、分子成像、医学诊断、药物传输和疾病治疗等领域有很大的应用潜能。但全细胞的核酸适配体筛选过程复杂,筛选难度大,筛选的适配体性能不佳是导致目前可用的适配体非常有限的主要原因。由于细胞表面蛋白质在提取纯化过程中分子结构和形态会发生改变,故以膜表面蛋白质为靶标筛选的适配体很难应用于识别整体细胞。以全细胞为靶标的核酸适配体筛选则不需要准确了解细胞表面的分子结构,筛选过程中可保持细胞的天然状态,以全细胞为靶标筛选出的核酸适配体有望直接用于全细胞识别。本文总结了2008~2015年全细胞的核酸适配体筛选的研究进展,介绍了靶细胞的分类、核酸库的设计、筛选条件和方法以及核酸适配体的亲和力表征方法等。并列出全细胞靶标的核酸适配体序列。

关键词: 核酸适配体 , 细胞 , 筛选 , 指数富集的配基系统进化技术 , 综述

蛋白质的核酸适配体筛选的研究进展

杨歌 , 魏强 , 赵新颖 , 屈锋

色谱 doi:10.3724/SP.J.1123.2015.12014

核酸适配体是通过指数富集系统配体进化( SELEX)筛选获得的,与靶标具有高亲和力和特异性结合的单链DNA或 RNA。蛋白质是生命进程中的关键功能分子。近年来,以蛋白质为靶标的适配体筛选在蛋白质相关的基础及应用研究领域受到广泛关注。核酸适配体应用性能的优劣取决于其亲和力、特异性与稳定性。目前,适配体筛选方法的优化主要是提高筛选效率、提升适配体性能及降低筛选成本。适配体主要筛选步骤包括复合物分离、核酸库优化、次级库的富集、适配体序列分析以及亲和力表征等。迄今为止,以蛋白质-核酸复合物的分离为核心步骤的适配体筛选方法有20余种。本文归纳总结了2005年以来以蛋白质为靶标的适配体筛选技术,讨论了各方法的缺陷与局限。介绍了核酸库的设计优化方法、适配体的序列特征,以及常用的亲和力表征方法。

关键词: 核酸适配体 , 蛋白质 , 筛选 , 指数富集系统配体进化 , 综述

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